Việc chỉ định nhà đầu tư chỉ được áp dụng khi đáp ứng một trong các điều kiện. Một là, trong thời hạn quy định tại khoản 2 Điều 10 Nghị định này (thời hạn tối thiểu để Nhà đầu tư lựa chọn và đăng ký thực hiện Dự án với Cơ quan nhà nước có thẩm quyền là 30 ngày làm việc kể từ ngày Danh mục dự án được đăng tải lần cuối theo quy định) mà chỉ có  một Nhà đầu tư đăng ký thực hiện Dự án.

Hai là, trường hợp quy định tại khoản 5 Điều 11 Nghị định này: Trường hợp Đề xuất dự án được phê duyệt, các Bộ, ngành, UBND cấp tỉnh quyết định bổ sung Dự án vào Danh mục dự án và đăng tải những nội dung cơ bản của Dự án theo quy định trên Trang thông tin điện tử của Bộ, ngành, địa phương và đăng tải trên Báo Đấu thầu trong 3 số liên tiếp. Trong thời hạn tối thiểu 30 ngày làm việc kể từ ngày đăng tải lần cuối mà không có Nhà đầu tư khác đăng ký tham gia, Các Bộ, ngành, UBND cấp tỉnh quyết định chỉ định Nhà đầu tư có Đề xuất dự án được phê duyệt để đàm phán Hợp đồng dự án.

Ba là, dự án cần thực hiện để đáp ứng nhu cầu cấp bách về việc sử dụng công trình kết cấu hạ tầng do Thủ tướng Chính phủ quyết định trên cơ sở đề nghị của Bộ, ngành, UBND cấp tỉnh và báo cáo thẩm định của Bộ Kế hoạch và Đầu tư.